宣宗道光五年,冬十月,以大学士长龄署伊犁将军,筹办军务,当乾隆朝之平定天山南路也。回酋大和卓木波罗泥都之子萨木克及喀什噶尔地方人民亡入浩罕国,于葱岭以西。其汗为蒙古察合台汗之裔,既纳萨木克等,恐遭战事上之波及,因告中国,愿担负监守逃人之责。政府亦因势利用之,岁贿以银一万两,使加约东。及嘉庆末年,南路参赞大臣斌静荒淫无度,失回众心。萨木克次子张格尔者,其人有胆力,自入浩罕后以诵经、祈福、传食诸部,颇为回人所崇奉。张格尔乃因南路人心之不平,乘机投入布鲁特,假众数百,以是年八月袭喀什噶尔近边。布鲁特硕目苏兰奇入关告警,反为章京绥善所叱,遂愤走出塞,与回人合,领队大臣色普征额率兵往击,破之。张格尔仅馀三十人,舍骑徒步而走。色普征额追出塞外,不见敌踪,遂回军喀什噶尔,与斌静宴赏中秋节。所擒八十馀人,斌静悉令杀之灭口,而以苏兰奇交通逆裔,导众滋事入奏,帝心疑之,命伊犁将军庆祥往勘,具得斌静奴畜回民,渔猎回女诸罪状,逮入京治罪,以永芹代之。张格尔复集兵,屡骚掠近塞,永芹引军出击辄遁云。至九月,令队大臣巴彦巴图以兵二百出塞四百里,复无所遇,乃纵杀布鲁特游牧妇孺百馀而还。其酋汰劣克愤甚,率所部二千追袭之于山谷间,巴彦巴图全军陷没,于是四城之回人争起响应诏,以长龄代庆祥镇守伊犁,庆祥代永芹视师喀什噶尔。

六年,秋八月,张格尔陷喀什噶尔,庆祥死之。先是,张格尔率兵由开齐山路突入回城,拜其先和卓之墓。距喀什噶尔八十馀里,令协办大臣舒尔哈善等围之。张格尔突围出,帝闻,授长龄扬威将军,诏陕甘总督杨遇春、山东巡抚武隆阿为参赞,督师助勤。军未集而张格尔已乞得浩罕国安集延兵〈(安集延兵鸷悍善战,时有百回兵不如一安集延之语)〉三千,于是月攻陷喀什噶尔。庆祥迎战于浑河,败绩,自缢死焉。凌河阿穆克登先后殁于阵,于是英吉沙尔叶同羌和间三城同时陷落,群回悉凌。

七年,春三月,将军长龄、总督杨遇春克复喀什噶尔,张格尔遁。先是,长龄等于六年十月抵阿克苏,时提督达凌阿已败敌于托什罕河,张格尔复遣兵所柯尔坪,阻进兵之路。长龄督将,并分路进,悉腊其众,至是年二月,师次大阿拐,敌屯洋河已特。乘夜来犯营,击却之。越日,由中路进袭,歼万馀人,追杀二十馀里,擒三千馀人。张格尔复纠众十馀万抗拒于沙布都尔庄,诸将奋勇抄击,逼至浑水河,又破之,遂进军阿瓦己特。三路掩杀,俘斩二万有奇,复追至洋达玛河,搜杀罄尽,遂于是月移师浑河北岸。回众十馀万阻河为阵,亘二十里,穴垒轰䂭,鼓角震天,势张甚。是夜,大风扬沙,大雾晦,长龄欲待霁而进,遇春不可,曰:‘此天赞我也。’乃遣索伦千骑,绕趋下游,牵其势而亲督。