湘军既复安庆省城，太平军益无能再争长江上游，则尽力驰骋于江浙。在江苏尤瞩目于上海，浙江则杭州省城再陷。其余郡城之仅存者，为衢州、温州，厅县城池之仅存者，为定海、石浦、龙泉、庆元、泰顺，全境几无一片干净土。清廷与曾国藩之布置，以左宗棠负规复浙江之责，而于江苏则以曾国荃围攻江宁省城，更以李鸿章驰援上海，由东而西。援浙固宗棠早在湖南巡抚幕中所主张，当景德镇与乐平之役告一段落时，清廷已授宗棠为太常寺卿，命率师援浙。国藩奏称，景德镇为全徽咽喉之地，婺源为皖浙绾毂之区，鲍超北渡后，南岸仅恃宗棠一军，纵横策应七百余里，不能分身，坐是未果行。咸丰十一年(1861)十月，浙事益急，清廷遂以宗棠督办浙江军务，嗣复徇国藩之请，授为浙江巡抚，由此宗棠得独当一面，意气益发抒。注217
先是，宗棠由湖南出发时，仅募练楚军合老湘营凡五千人。及入江西、安徽，陆续增至八千人。至是奉命督师浙江，请以蒋益澧就所部募成数千赴浙当一路。益澧即率湘军援广西，为宗棠所赏识者也。复以刘培元募勇三千相随，培元久在湖南治军，谙习水战，宗棠期以在浙募练水师者也。清廷一一报可，以益澧任浙江布政使，培元署衢州总兵。国藩亦奏准以驻防徽州之张运兰，驻防广信之屈蟠，驻防玉山之王德榜、顾云彩，驻防广丰之段起各军，以及孙昌国所部在弋阳一带之内河水师，悉归宗棠指挥。旋又益以魏喻义一军，俾共维护后路，一面将向所指定为宗棠在赣东与皖南时饷源之婺源、浮梁、乐平、景德镇、河口等五处税厘，仍由宗棠自行派员经理，以裕军食。注218
此时浙江之情势，李定太一军苦守衢州，李元度领安越军屯江山，福建军屯处州、松阳、龙泉、政和，而别部屯温州。江苏之美国常胜军，渡海收定海，台州民团方规取本郡列县，湖州义士赵景贤犹困守府城。太平军以侍王李世贤据金华，为各方策应。宗棠与国藩计议，以固徽州，保饶州、广信，为规浙后方之根本。故宗棠之战略，亦主先由婺源攻开化，以清徽州后路，分军攻遂安，俾饶州、广信相庇以安，然后傍徽州，取道严州，节节进剿，诚以鉴于前此督师者仅知向前攻取，而于所攻取之境地，不知顾复，往往随得随失，徒使人民多受一番蹂躏。故宗棠自矢，不得地则已，既得必使弗复失也。注219
同治元年(1862)正月，宗棠之旌旗东指，一如所预计。先分道攻开化，四日而肃清之，毙太平军五千人，以王开来留守。继攻遂安，二日而克复之，毙太平军一万人，以王文瑞留守。先声之气夺人，据守之点胥定。金华、严州等处太平军屡出袭击衢州、江山，更围遂安，终不获逞，然湖州府城又以失守闻矣。注220
此后军事，可分数部分言之。宗棠之直辖部队，由高连升之取寿昌，而有魏喻义之复严州，由蒋益澧之取汤溪，王德榜、刘明灯等之取龙游，而有连升之更复金华。自是刘典攻兰溪，黄少春攻浦江、诸暨，均先后收复。喻义复一举而下桐庐。同时，将侵扰衢州之太平军，陆续击退，便就衢州建立水师，此由西向东推进者也。注221已革宁绍台道张景渠先招致海盗，收镇海，嗣会外国军规复宁波、慈溪、象山、余姚、奉化、上虞，更攻破绍兴府城而直趋萧山下之，遂据守钱塘江南岸，此由东向西推进者也。注222台州民团悉定本郡所属，且协克绍兴府属之新昌、嵊县。福建军秦如虎于收复乐清、青田后，克骤失之处州。林文察更先后规复松阳、宣平、武义。同时，民团收永康，而东阳、义乌之太平军悉走，此由南向北推进者也。注223于是浙东之金、衢、严、宁、绍、台、温处七府属均还隶清廷。其太平军之出没温州各处，牵制前线者，既均无力，而多方滋扰徽州一带，挠阻后路者，亦被击破(另详十七节)。盘踞杭州省城之太平军，用是震怖，悉众拒集富阳。而宗棠于斯时又被命为闽浙总督，仍兼浙江巡抚，位望日重。其间于三日内连克汤溪、兰溪、龙游、金华四坚城，共计杀敌五六万，最称伟绩。而汤溪之役，尤为严重，以益澧全军益以福建之康国器一军，方得合围，而城中太平军犹有十万，坚守莫却。其由宁波、绍兴两府属撤退之太平军，又悉聚金华，相继窜扰围师。后复于金华、汤溪两城间筑坚垒，连十数里。益澧并力开地道，轰城垒，终弗克。逾时三月，始乘城中局部太平军通款之机，伏兵壕中，突起斩通款者八人，一拥从西门而入。注224汤溪、龙游两城，均为通金华要道，而金华府城最得地势，垣墉坚固异常。兰溪则一水直达严州，严州外通徽州、宁国，内达杭州省城，素为形胜，宗棠一军连得此数重地，制胜之机固已牢牢在握矣。
宗棠规浙军事，至此阶段，进一步自以夺取杭州省城为主要目标。顾宗棠以为欲取杭州，先必西取余杭，东取海宁，方可绝杭敌之接济，而速杭城之陷落。又以为徽州、广信各属太平军犹出没无常，一旦杭城克复，太平军势必益窜入皖赣，彼时仍为后路之忧，虽复杭城，奚补于浙局。于是复分军回皖、赣剿击(另详十七节)，一面移军下富阳，再进攻余杭。同时，更以一军收海宁，并下桐乡。宗棠之规富阳也，水陆并进，而以益澧之万人为主力。盖将欲进取杭州，固不能不先取余杭，而尤不能不先取富阳。在太平军欲据守杭州，亦不得不先保余杭，而尤不得不先保富阳。且钱塘江自桐庐七里泷以下，地势渐平，江面渐阔，富阳县城背江面山，右阻一溪，形势素完固。故双方对于富阳之攻守，颇为猛烈，不特杭州太平军倾众来会，即嘉兴、常州、苏州之太平军并麇至。宗棠亦发严州驻军及康国器所部益之，争持至半年余，益澧部将熊建益且死之，最后调法国军德克碑洋枪队，用炸炮猛轰，昼夜不绝，太平军乃不支。注225宗棠初不甚信洋枪队，至是始认识其威力，以后围攻杭州、湖州等城，均利用之。
富阳既克，益澧径进杭州，而以别部取余杭，然其所遇阻力，又如富阳。太平军于余杭与杭州之纵横四十里间，满布营垒。于是先之以国器、喻义，继之以明亮、声恒，再继之以昌濬各军，亦历时半年余，终不获克。注226会李鸿章之淮军由枫泾入浙，克嘉善，乘势收平湖、乍浦、海盐，连升遂与会师复嘉兴。注227益澧等先已薄杭州，牵制其策应余杭。至是城内太平军势日蹙，其首领听王陈炳文忽请降，已而又忽杀城中谋内应者。宗棠谓有隙可乘，决先令益澧并力攻取杭州省城，以刘清亮攻钱塘门，连升、德克碑等攻凤山门，王月亮等攻清波门，刘连升等攻望江门、清泰门。益澧亲至武林门督战，别遣徐文秀攻城北长街，如是协攻亘数日，至同治三年(1864)二月二十三日之夜，陈炳文开北门出走，益澧闻城柝渐稀，顷之，人声鼎沸，知太平军已逃，即整部入城。诸军分门大进，而余杭太平军首领康王汪海洋亦弃城走。次日，以收复杭州省城并收复余杭之捷闻，清廷命宗棠加太子少保衔，赏穿黄马褂。当承平时，杭州城内外居民男女八十一万口，及复城，才十七八万口。宗棠申虏获之禁，妇女财物，各从其主，制止军士入民居，招商开市，奏停杭关税，立清赋局，减杭、嘉、湖三郡额赋漕粮三之一，益澧履布政使任，亦轻财致士，杭垣善后事一时翕然称之。注228
太平军失杭州省城后，更不振。于是声恒、大春等取武康，连升取德清，而石门太平军自逸。刘璈取孝丰，生擒感王陈荣，到处势如破竹，已而长兴亦为淮军所复。注229于是太平军在江浙两省之重要据点，仅余湖州府城与江宁省城两处。而湘军攻江宁省城已合围，故两省太平军，除西窜者外，几悉聚于湖州，其首领有堵王黄文金，佑王李远继，辅王杨辅清。及湘军复江宁省城，太平天国幼主洪福瑱亦潜入湖州。宗棠令益澧领军进攻，一军由德清向西南进，一军由石门向东南进，而别遣一军攻菱湖。同时，淮军以一军屯泗安，而以别一军向湖州东驱。湖州太平军为欲保此一隅，以维其在东南之势力，亦多方抵御，尤以晟舍之争为剧。晟舍在湖州府城东南，合宗棠军、淮军，更益以法国军，协力猛攻，历一月有半，仅乃克之。由是湖州府城合围，城中太平军多归诚，于七月二十七日收复。次日，昌濬又取安吉，洪福瑱与余党西逸，于是浙西之杭、嘉、湖三府亦定，全省告肃清。宗棠所部严追，戮其堵王黄文金，昭王黄文英，及洪福瑱于玉山，几获之，卒被兔脱，后在江西就逮。宗棠奉封一等伯爵，赐号恪靖。注230
以数百万太平军，几拥有全浙之势力，而在宗棠指挥下，以不满三年之时间，摧陷而廓清之，似不能不谓为神速。惟吾人事后检讨当日宗棠军事之成功，不能不谓有得乎两种助力。一为民众之响应。如台州府列县，处州等府若干县之光复，殆全为当地民团所致。严州之光复，有城内居民潜以太平军虚实相告，诸暨之光复，有民团之内应，绍兴之光复，亦有城内居民举火为内应。二为敌人之款附。如因罗埠敌首李世祥之约降，而获进攻汤溪，又以汤溪敌之通款而城遂突陷。因方蒂桂、张茂夫、程为懋等之投诚而复诸暨。因会王蔡元隆之输款而海宁不攻而得。又以蔡元隆进攻桐乡而城敌何培璋亦降服。而淮军之收取平湖、乍浦、海盐、嘉善，并系守城太平军自行反正。(平湖降者陈殿选，乍浦降者熊建勋，嘉善降者陈占榜、余嘉鳌，海盐之降，则为熊建勋所撮合。)至杭州省城陈炳文先遣使诣鸿章约降，鸿章令至宗棠所。已而陈炳文所部被杀，内应已中变，宗棠密知其状，仍报许之，而急督军进攻，城敌自相疑忌，遂为宗棠所乘。自杭州省城陷，而师行所至，各城太平军几无不望风而转，此种情况，为前此所罕有。于以见太平军至此地步，已外不为人民所悦服。内不为袍泽所诚信，其势早成强弩之末。注231