樊子鹄,代郡平城人。他的祖先是荆州蛮族的首领,迁徙到代地。父亲樊兴,任平城镇长史、归义侯。普泰年间,子鹄获得很高的官位,樊兴被赠封为荆州刺史。

  子鹄遭遇北镇的动乱,向南避至并州,..朱荣任他为都督府仓曹参军。..朱荣派他到京城,灵太后询问..朱荣军队的情形,他的回答很让灵太后满意。太后奖励他,命他为直斋,封为南和县子,让他回到..朱荣那里。建义初年,朝廷命他为晋州刺史。封爵为永安县伯。永安二年(529),因招降叛乱的蜀人有功,被晋封为中都县公。又兼任尚书行台,为政颇有威信。不久,朝廷又授予他督官尚书、西荆州大中正。后来,兼任右仆射,任行台。当时,..朱荣在晋阳,京城的事都委托子鹄办理。所以他在台阁,连续升迁并受到重用。后来,出任为殷州刺史。这年荒旱歉收,子鹄怕人流亡到别处,便命殷实之家将贮藏的粮食分别接济贫穷之家。并派耕牛代替人力,多种植大麦和小麦,州内因此十分安定。

  ..朱荣被朝廷处死,..朱世隆写信召请子鹄,他没有服从。因母亲住在晋阳,他请求朝廷让他移镇黄河以北,孝庄帝很赞赏他,任他为都督、豫州刺史。他行至汲郡,听说..朱兆领兵进入洛阳,便渡过黄河拜见..朱仲远,仲远派他镇守汲郡。..朱兆命他到洛阳,责备他对..朱氏存有二心,夺去他率领的军队,让他回晋阳。东海王元晔命他为侍中、御史中尉、中军大都督。

  太昌初年,他兼任尚书左仆射、东南道大行台。总大都督杜德等追讨..朱仲远,仲远逃向梁,杜德收编了仲远的兵马。这时,南梁派元树入犯北魏,占据谯城,朝廷命子鹄与杜德一起讨伐梁军。元树大败,逃进城去,魏军包围了谯城。元树请求撤兵南归,把占领的土地归还给北魏,子鹄允许了。等到元树的军队有一半出城,他又领兵进击,把南梁军队打败,抓获元树和梁委任的谯州刺史朱文开。班师回来,他升任为吏部尚书,转任尚书右仆射。不久,加封为骠骑大将军、开府,负责选拔官吏。

  后来,任兖州刺史。他先派心腹到百姓中查访,询问那里为政的得失。刚上任到达兖州境内,太山太守彭穆参拜长官失去礼仪,子鹄责备彭穆,并历数他过去的罪状,彭穆都一一承认,于是州内官员大为震骇。

  孝武帝西奔长安,子鹄据守城池作为接应,南青州刺史大野拔率部属前来投奔子鹄。天平初年,高欢派仪同三司娄昭等率兵进攻子鹄驻守的城池,很久不能攻下,娄昭用水灌城。大野拔借故求见子鹄,命左右随从将子鹄杀死,向敌兵投降。