周起元（1571年－1626年），字仲先,海澄 (今福建龙海)人。万历二十九年 (1601) 进士。历知浮梁、南昌,以廉著称。行取入都,注湖广道御史。时魏忠贤党攻东林,疏诋顾宪成,他乃抗疏驳斥,与党人牴牾。任陕西巡按,风采甚著。累升右佥都御史,巡抚苏、松十府。公廉爱民,丝粟无所取。屡颂苏州同知杨姜廉谨,诋忠贤党李实诬毁,复弹劾实贪恣不法。魏忠贤遂怨恨。用矫旨把他革职。又诬他任巡抚时贪污库金,逮毙狱中。庄烈帝嗣位,赠兵部右侍郎。福王时,追谥忠惠。
